Osud galaxie je nejistý a Master Chief je jediný, kdo může zachránit lidskou rasu. Celý impozantní příběh se obloukem dostával k tomuto bodu. Master Chief, poslední svého druhu, je válečník zrozený pro boj, vychovávaný pro válku, je jedinou nadějí lidstva. Po té, co byl "uklizen" ze Země na vesmírné lodi s příznačným jménem Forerunner musí geneticky upravený a kyberneticky zdokonalený Spartanský "supervoják" uhánět zpět na Zem, aby zastavil armádu Covenantů jednou pro vždy a zachránil tím lidstvo. V sázce je příliš mnoho na to, aby mohli udělat něco jiného, než postavit se jim čelem. V HALO3, třetím pokračování legendárního eposu, se válka dostává do svého závěru. Flood roste v počtech i síle, vojska Země jsou rozptýlena a decimována a je zde hrozba Covenantu aktivovat Halo, jež je schopno zničit veškerý život v galaxii.